Das Herzstück des Schulgebäudes ist das Atrium. Dieser große helle Raum wird für Segensgebete, Dommusikstunden, Monatssingen, Bewegungsstunden und weitere Aktivitäten regelmäßig genutzt.
In der Mitte gibt ein Lichtschacht den Blick auf den Himmel frei. Die beiden Etagen, die dazwischen liegen, haben jeweils Fenster zum Lichtschacht, sodass aus allen Etagen der Blick ins Atrium möglich ist.